擴增子測序（18S/ITS/16S）
產(chǎn)品簡介（以16S為例）
16S高通量測序主要用于研究環(huán)境或糞便等樣本中細菌群落的結構和多樣性。由于16S rRNA在不同種類的細菌中具有高度保守性和變異性，因此被廣泛用作細菌分類和鑒定的分子標記。
在16S高通量測序過程中，首先通過PCR技術擴增樣品中的16S rRNA基因特定區(qū)域（如V3-V4區(qū)、V4區(qū)或V4-V5區(qū)等），然后對擴增產(chǎn)物進行高通量測序，這些序列數(shù)據(jù)可以與已知的16S rRNA基因序列庫進行比對，從而識別并分類樣品中存在的微生物。通過對不同樣品中微生物群落結構的比較，可以揭示微生物群落的多樣性和分布規(guī)律，為環(huán)境科學研究、醫(yī)學診斷、生物技術應用等領域提供重要信息。
技術優(yōu)勢
1.價格公道合理。
2.樣品處理經(jīng)驗豐富。
3.分析內容豐富，一站式科研解決平臺。
儀器平臺
Illumina Miseq/Novaseq
服務流程
分析內容
| 生信分析條款 | 分析內容 |
數(shù)據(jù)處理 | 數(shù)據(jù)過濾 Reads拼接 |
OUT及其豐度分析 | OTU統(tǒng)計 OTU venn圖分析 Core-Pan OTU分析 OTU PCA分析 物種累計曲線分析 OTU PLS-DA分析 OTU Rank曲線 |
物種及其豐度分析 | 物種注釋 物種豐度熱圖 物種系統(tǒng)發(fā)育進化分析 |
樣品多樣性分析 | 單個樣品多樣性分析（Alpha 多樣性） 樣品間多樣性比較分析（Beta 多樣性） 樣品間物種組成聚類分析 |
組間差異分析 | LEfSe 分析 T檢驗 Wilcox Test Kruskal Test |
功能預測（PICRUSt） | 功能預測 功能差異分析（T檢驗、Wilcox Test） |
高級信息分析 | 與客戶協(xié)商后，按照實際情況執(zhí)行 |
送樣建議
| 糞便 | ＞100mg | 液氮速凍，-80℃保存，干冰運輸 |
土壤 | ＞200mg | 液氮速凍，-80℃保存，干冰運輸 |
結果展示
案例分析
中國農(nóng)業(yè)科學院蘭州獸醫(yī)研究所王帥課題組在npj Biofilms and Microbiomes雜志在線發(fā)表一篇題為：Interaction between tissue-dwelling helminth and the gut microbiota drives mucosal immunoregulation的論文，通過16S高通量測序等方法，發(fā)現(xiàn)多房棘球蚴可以通過調節(jié)腸道菌群治療腸道炎癥，揭示了重要的腸道炎癥治療機理。
研究人員采用腸外寄生的多房棘球蚴模型，探討了宿主-蠕蟲-細菌在調節(jié)宿主結腸Treg中的互作關系機制。研究發(fā)現(xiàn)，腹腔感染多房棘球棘可減輕Balb/c小鼠的結腸炎，并誘導結腸Foxp3+Treg細胞群顯著擴增。通過16S高通量測序等技術發(fā)現(xiàn)，棘球蚴感染后宿主腸道微生物群結構和代謝能力發(fā)生了顯著變化，這些變化的微生物促進了Treg的增加。該研究初次證明腸外寄生的蠕蟲可以通過宿主腸道微生物中的益生菌驅動宿主結腸Treg的擴張，揭示出了復雜的互作機理，為腸道炎癥的治療提供重要的參考。另外，本研究也揭示了重要人獸共患寄生蟲病-棘球蚴病對宿主的免疫調節(jié)機制，為棘球蚴病的新型防治技術開發(fā)提供方向。
